Seit der Reformation als Keller benutzt, wurde die Nydeggkirche 1566 wieder eröffnet, was Anlass zu Fenster- und Wappenstiftungen bot. Laut den Seckelmeistereintragungen umfassten die damaligen Stiftungen sieben Fenster (mit Wappen), für die Simon Steinegger wohl als ausführender Glasmaler und Mathis Walther wohl als Glaser entlohnt wurden. 1668 erhielt die Nydeggkirche erneut mehrere Scheibenstiftungen, von denen ein Teil dort noch erhalten ist. Anlass dazu bot die damalige Kirchenerweiterung im Schiff und Chor zur Behebung der Raumnot. Die Haupterneuerung betraf den "Lättner", das heisst den Einbau der Doppelempore vor der Norwest- und Westwand. Zugleich wurde die Westfassade mit zwei Rundbogenfenstern versehen.
1810/11 wurden die alten Glasgemälde in neuer Anordnung in die damals neu gemachten sechs Chorfensterflügel eingefügt. 1929 erfolgte eine Neuverglasung der Schifffenster, wobei man die alten Scheiben neu gruppierte und in die Schiff- und Chorfenster einfügte (Hofer/Mojon 1969). Anlässlich der Restaurierung von 1951–1953 wurden die alten Glasgemälde und die drei Scheiben des 19. Jahrhunderts in die neu verglasten Südostfenster des Langhauses sowie ins Fenster des Pfarrerzimmers versetzt (Hofer/Mojon 1969).

Das Glasgemälde des Sigmund von Erlach sahen Franz Thormann und Wolfgang Friedrich von Mülinen 1896 noch in der Nydeggkirche, und zwar im Fenster rechts im Chor. Wann genau dasselbe aus der Kirche entfernt wurde, konnte bislang nicht geklärt werden. Spätestens 1951 war es jedenfalls nicht mehr dort. 1962 befand es sich dann im Depot von Glasmaler Paul Wüthrich in Bern (Hofer/Mojon, S. 273, Anm. 1).
Wie die anderen 1668 in die Nydeggkirche gelangten Scheiben wurde auch diejenige des Sigmund von Erlach in der Werkstatt Hans Jakob Güders gefertigt. Zum Vergleich bietet sich unter anderem die ebenfalls 1668 entstandene, von Güder signierte Scheibe des gleichen Stifters in der Kirche Steffisburg an.

Sigmund von Erlach (1614–1699), Herr zu Spiez und Schadau, war ein Sohn des Johann Rudolf III. von Erlach (1577–1628) und ein Neffe des Berner Schultheissen Franz Ludwig von Erlach (1575–1651). Unter Bernhard von Weimar wurde er Oberst über ein Regiment in Deutschland und 1648 Maréchal de champ in französischen Diensten. In Bern war er seit 1645 Mitglied des Grossen und seit 1652 des Kleinen Rats. Er diente 1653 als General im Bauernkrieg und 1656 im 1. Villmergerkrieg und wurde 1667 Venner zu Schmieden sowie 1670 Salzdirektor. 1675 wurde er erstmals Berner Schultheiss. Von da an bis zu seinem Tod übte er dieses Amt alternierend aus. Als Gesandter begab er sich unter anderem zu König Ludwig XIV. nach Breisach (1673) und nach Ensisheim (1681). Seine 1638 mit Ursula Esther von Mülinen geschlossene Ehe blieb kinderlos (von Erlach 1989, S. 303–328; HLS 4/2005, S. 258f. mit Abb. des Bildnisses von Erlachs im Bernischen Historischen Museum).
Die Wappenscheibe, die Sigmund von Erlach 1668 in die Nydeggkirche von Bern schenkte, befindet sich heute in Privatbesitz (BE_60). Zudem gibt es von ihm die Doppelscheibe von 1676 aus der Kirche Spiez im dortigen Schlossmuseum sowie je ein 1681 in die Kirchen von Jegenstorf und Steffisburg verehrtes Glasgemälde.