Les dix-sept verrières en plein cintre de la nef forment un ensemble continu homogène, constitué de motifs abstraits s’imbriquant les uns dans les autres et se prolongeant sur la fenêtre suivante.
Les quatre premiers vitraux, à partir de la tribune, se composent de divers coloris (vert, divers bleus) avec une dominante de rouge et quelques touches de orange. La cinquième verrière, majoritairement composée de différentes nuances de bleu, accueille encore une touche de rouge, d’orange et de mauve, ses deux dernières couleurs se déployant au milieu des bleus sur les trois fenêtres suivantes avec quelques apparitions de vert. Les bleus perdent leur prépondérance sur les fenêtres suivantes, jusqu’au choeur, et sont accompagnés par des mauves, des orange et des jaunes, l’équilibre de tons chauds et froids s’installant sur les cinq dernières baies.

L’ensemble des vitraux de la nef de l’église Saint-Pierre-aux-Liens de Mézières, comme les quatre verrières de la tribune côté nord-est, a été réalisé en 1979 par l’artiste fribourgeois Yoki (Émile Aebischer), dix ans après son oeuvre en dalle de verre pour la rose de la tribune, réalisée en collaboration avec le maître-verrier Michel Eltschinger (Aebischer, Eltschinger, 1979).
Lorsque l’architecte de l’église, Fernand Dumas, présente à la commission de bâtisse son devis descriptif en 1937, il envisage pour la nef “des vitraux en verres de couleur avec dessin géométrique” (Dumas, 1937). Il faudra plus de quarante ans pour que cette vision devienne en quelque sorte réalité.

Les vitraux de Yoki ont remplacé de simples vitreries en verre cathédrale de différentes couleur, réalisées en 1939 par l’atelier fribourgeois Kirsch et Fleckner (Kirsch et Fleckner, 1939b), qui venait de poser les vitraux ornementaux du choeur dessinés par Cingria (Kirsch et Fleckner, 1939a). Les derniers “vestiges” de ces vitreries sont encore visibles aujourd’hui sur les deux baies étroites de la tribune côté sud-ouest (GSL_430) et dans les fenêtres du baptistère (GSL_482). Ils nous permettent d’entrevoir à quoi pouvait ressembler l’ensemble des fenêtres de la nef avant la pose des vitraux de Yoki. A la fin de l’année 1943, la paroisse écrit à l’entreprise fribourgeoise de vitrerie Zosso-Sauterel que les fenêtres de la nef, particulièrement côté hommes, deviennent dangereuses, une bonne partie des verres étant fendus. Des morceaux de verre pouvant se détacher et tomber, ce qui était déjà le cas pour certains, elle lui demande de prendre des mesures préventives immédiates (Conseil paroissial, 1943).
Malgré cet état quelque peu désastreux des fenêtres de la nef moins de cinq ans après leur pose, il faudra attendre plus de trente ans pour que la réalisation de nouveaux vitraux soit évoquée en assemblée paroissiale en 1974 (Oberson, Pittet, 1974). L’argent manquant, ce n’est que deux ans plus tard que la question est à nouveau au centre des discussions, en même temps que la peinture intérieure de l’église (Morel, Oberson, 1976). Pour cette rénovation intérieure, le conseil de paroisse appelle Yoki comme conseiller artistique (Morel, Oberson, 1977a), lui qui avait participé à la construction de l’église en tant que dessinateur dans le bureau de Fernand Dumas, et qui est pressenti pour la réalisation des nouveaux vitraux. Après avoir visité différents édifices comportant des vitraux récents de divers artistes, la paroisse confirme sa préférence pour Yoki (Morel, Oberson, 1977b). Lors d’une assemblée paroissiale en avril 1978, l’artiste procède à une présentation en image sur l’art du vitrail et montre sa première maquette provisoire. Il reçoit un accueil très favorable (Morel, Oberson, 1978a), tout comme, à la fin de l’année, par la Commission d’art sacré (Perroud, Richon, 1978). En novembre, L’artiste expose ses maquettes dans l’église (Morel, Oberson, 1978b). En mars de l’année suivante, le conseil de paroisse visite l’atelier de Michel Eltschinger pour découvrir l’avancement du travail (Morel, Oberson, 1979). Les vitraux sont posés au printemps.

Le contrat entre la paroisse, Yoki et le verrier Michel Eltschinger stipule que les vitraux doivent “laisser en bonne lumière les éléments du décor qui ornent le plafond et les murs” (Aebischer et Eltschinger, 1978). Ce qui veut dire, en d’autres termes, qu’ils ne doivent nullement concurrencer la décoration, mais la mettre en valeur. Ces contraintes ne sont pas des plus aisées pour un artiste, mais pour Yoki, artiste-verrier expérimenté, habitué à tenir compte du contexte architectural et décoratif et sachant jouer avec habilité avec le choix des couleurs, leurs valeurs, leurs forces et la subtilité de leur nuance, ce défi a dû le réjouir et le motiver. Imaginant l’ensemble des verrières de la nef comme un tout homogène, il choisit néanmoins des coloris tranchés (bleu, rouge, vert, orange), et crée entre les vitraux des passages de couleurs qui deviennent ensuite dominantes dans les verrières suivantes. Les huit fenêtres les plus proches du choeur côté nord-est reprennent les teintes choisies par Cingria pour les baies géométriques du choeur. C’est certainement un clin-d’oeil volontaire de Yoki qui, durant ses jeunes années, voyait l’artiste genevois comme un modèle.

Le Vitromusée Romont conserve, dans le fonds graphique de ses oeuvres, une des deux maquettes pour ces vitraux de la nef. Elle dévoile un état pratiquement définitif du projet.