Der rechte Bogenteil und ein Teil der Helmdecke alt ergänzt; ein Teil des Himmels und der Helmzier sowie je ein Stück des Wappens, des Helmes, der Helmdecke, der Säulenbasen unten links, der Inschrift und des Rasens neu ergänzt; die Schwarzlotbemalung stellenweise beschädigt; Sprünge und Sprungbleie; die Verbleiung erneuert.
Kasser sah 1890 in den "ältern und grössern Scheiben Bruchstücke eingeflickt" (S. 57). Diese wurden bei einer der darauf folgenden Restaurierungen durch Ergänzungen ersetzt.

Restaurierungen
1721/22 Glaser Kräuchi in Bäriswil. Dieser führte damals eine Restaurierung aus: "Glaser Kräuchi zu Bärisweil die beschädigten Chorfenster zu Kirchberg zu reparieren 44 Pf." (Amtsrechnung Burgdorf 1721/22, Staatsarchiv Bern; dazu Heinz Matile, in: Kat. Manuel 1979, S. 427f.).
1899 Atelier Gustav Giesbrecht, Bern. Damals wurden vierzehn Kirchberger Glasgemälde im Berner Atelier von Gustav Robert Giesbrecht neu gefasst und bei diesem Anlass für 14 Tage im Bernischen Historischen Museum ausgestellt (Jahresbericht BHM Bern 1899, S. 27).

Die Doppelscheibe von Alexander Stokar und seiner Frau Margaretha Tschachtlan auf der südlichen Langseite des Chores befand sich bereits im 19. Jahrhundert an dieser Stelle (vgl. Rahn 1883; Kasser 1890). Alexander Stokar († 1519) aus Schaffhausen war Hauptmann im Dienste Kaiser Maximilians I. und wurde von diesem 1501 geadelt. 1512 war er Anführer der Schaffhauser am Pavierzug. Verheiratet war er mit Margaretha Tschachtlan aus Bern, einer Nichte des Kirchherrn von Kirchberg Ludwig Schwab. Zudem war ihr Vater Benedikt Tschachtlan († 1493) Schultheiss zu Burgdorf, d. h. er führte das bernische Schultheissenamt Burgdorf, in dem sich Kirchberg befand (vgl. von Tavel 1978, S. 225). Margarethas Ehemann Alexander Stokar aus Schaffhausen war Hauptmann im Dienste Kaiser Maximilians I. und wurde von diesem 1501 geadelt. 1512 war er Anführer der Schaffhauser am Pavierzug. 1514 wurde ihm vom Berner Rat eine Standesscheibe nach Schaffhausen verehrt. Stokar, der Schwiegervater von Hans Franz Nägeli, betätigte sich selbst vielfach als Fenster- und Wappenstifter (dazu Hasler 2010, S. 43).

Die beiden Scheiben weisen enge stilistische Parallelen zu den Glasmalereien der Bubenberg-Stiftung im Berner Münster auf und sind somit derselben Werkstatt wie diese zuzuordnen. Insbesondere stehen ihnen die Wappenscheiben des Peter Stolz und des Bartholomäus May (Kurmann-Schwarz 1998, Abb. 276, 282) nahe. Da sich diese Werkstatt mit keinem Namen verbinden lässt, wird sie als Bubenberg-Werkstatt bezeichnet (vgl. Kurmann-Schwarz 1998, S. 373–74, 401–414). Lehmanns Zuschreibung an Lukas Schwarz, dem sich kein erhaltenes Glasgemälde zuweisen lässt, ist sicher abzulehnen (vgl. Lehmann 1913).