C’est sous l’impulsion du curé de Confignon, B. de Pontverre, qu’une première église est érigée à Lancy en 1699. C’est une petite chapelle. Placée sous le vocable de la Trinité, elle est agrandie une première fois par J. Vanière et P. Pellaton du côté du chœur. En 1732, avec l’appui du souverain sarde, la nef est elle aussi agrandie, le choeur est voûté d’arêtes et le reste est rénové. Une plaque gravée dédie l’église à Victor-Amédée I et Charles-Emmanuel II. En mars 1816, avec le Traité de Turin, Lancy devient genevoise. En 1873, le Kulturkampf chasse du sanctuaire les catholiques romains pour les remplacer par les catholiques libéraux. Contrairement aux autres églises, elle restera leur propriété. En 1890, l’église subit une nouvelle rénovation. Le choeur est agrandi par une abside néo-gothique; trois vitraux y sont posés. Au début du XXe siècle, la façade occidentale est modifiée et l’ancien porche substitué par un nouveau. Le clocher savoyard au-dessus de la porte d’entrée est remplacé par un clocher latéral. En décembre 1921, l’édifice est classé monument historique. En 1922, L. Uldry réalise des peintures murales. En 1933, la charpente et la couverture du clocher sont refaites. Dès 1960, une restauration complète est entreprise avec l’intention de revenir au style de l’église de 1732 en supprimant tous les apports du “Heimatstil”. En 1974, une oeuvre en verre de M. Schüpfer est posée. Le 16 novembre 1975, l’autel est consacré par l’évêque L. Gauthier. Entre 1984 et 1985, une restauration est effectuée sur les façades et les toitures et un nouvel orgue est posé. En 1995, des travaux de nettoyage extérieurs sont réalisés. (BERTRAND 1975 / BRULHART-DEUBER-PAULI (1985) 1993)