Die Kreuzigungsscheibe befand sich bereits im 19. Jahrhundert an der heutigen Stelle im Langhaus (vgl. Rahn 1883). Nach einer undatierten Notiz aus dem 19. Jahrhundert soll im Triumphbogen dieser Scheibe damals die Jahreszahl "1506" zu sehen gewesen sein (Heinz Matile, in: Unterlagen BHM Bern). Heute befindet sich an ihrer Stelle eine Ergänzung.
Der Stifter der Scheibe ist nicht bekannt.

Wie Hans Christoph von Tavel aufzeigte, besitzt diese aussergewöhnliche Kreuzigungsscheibe stilistische Analogien nicht nur zur Madonnenscheibe (s III, 4a) in Kirchberg, sondern auch zu Holzschnitten Hans Baldung Griens (von Tavel 1978, Abb. 15, 16). Er erklärt dies dadurch, dass entweder Vorlagen Baldungs über Niklaus Manuel nach Kirchberg gelangten oder aber Manuel selbst für dort unter dessen Einfluss Entwürfe herstellte (von Tavel 1978, S. 228; vgl. Lehmann 1913).
Niklaus Manuel schuf also offenbar nicht nur für die Burgdorfer Stiftungen (s III, 3b/s III, 4b), sondern auch für andere Scheiben in Kirchberg Entwürfe, die alle in der gleichen Glasmalerwerkstatt zur Ausführung gelangten. Während ein direkter Bezug der Kirchberger Scheiben zum Werk des im Elsass tätigen Hans Baldung Grien unwahrscheinlich ist, legt die durch von Tavel aufgezeigte stilistische Verwandtschaft eine Rezeption von Baldungs Werk durch Manuel bereits in dieser Zeit nahe (vgl. Kat. Manuel 1979, S. 47f.).

Die Kreuzigungsscheibe weist stilistische Parallelen zu den Glasmalereien der Bubenberg-Stiftung im Berner Münster auf und ist somit derselben Werkstatt wie diese zuzusprechen. Da in der betreffenden Werkstatt mehrere Hände arbeiteten, die sich mit keinen Namen verbinden lassen, bezeichnet Brigitte Kurmann-Schwarz dieses Atelier als Bubenberg-Werkstatt (Kurmann-Schwarz 1998, S. 373–74, 401–414). Hans Lehmanns Zuschreibung der Kreuzigungsscheibe an Hans Hänle, dem sich kein erhaltenes Glasgemälde zuweisen lässt, ist abzulehnen (vgl. Lehmann 1913).

In der Sammlung von Reding in Schwyz (Hasler et al., 2020, S. 40) befindet sich eine in Stil, Komposition und Format mit dem vorliegenden Glasgemälde übereinstimmende, laut André Meyer aus einer Berner Landkirche stammende Scheibe mit der Kreuzabnahme Christi (SZ_4, Meyer 1978, S. 367, Nr. 18). Dass ihr ursprünglicher Standort die Kirche Kirchberg war und dass sie dorthin gemeinsam mit der Kreuzigungsscheibe gestiftet wurde, ist kaum zu bezweifeln.