La chapelle protestante est construite vraisemblablement par l’architecte Henri Juvet en 1890 grâce à une donation de Madame Maracci-Moricand. C’est un simple local rectangulaire avec un portail néo-gothique et un clocheton (Brulhart et Deuber-Pauli, 1993, p. 251). En 1957, une restauration est faite. En 1990, des interventions sur la toiture et le clocheton sont menées. En automne 2011, une grande restauration intérieure et extérieure est réalisée. La nouvelle chapelle est inaugurée le 7 octobre 2012 (Fondation pour la conservation des temples genevois avant 1907, Chapelle d'Anières). Cinq vitraux de Bodjol sont offerts à la paroisse en 2018 par l’Association pour la Promotion de l’Art sacré (APAS). Quatre sont placés devant les fenêtres de la nef alors que le cinquième est installé dans un local paroissial. Ces verrières proviennent du Centre communautaire oecuménique d'Avanchet, vendu en 2016 par les églises protestante et catholique à l’église pentecôtiste. Ce nouveau propriétaire a déposé l’ensemble des fenêtres qui a été sauvé in extremis par l’APAS. Ce cycle de vingt vitraux avait été commandé à l’artiste par Jean-Jacques Buard, alors pasteur de la paroisse protestante de Cointrin-Avanchet pour orner les dix paires de fenêtres carrées du centre (Buard, 2018).