Das 1125 gegründete, dem hl. Ulrich und der hl. Afra geweihte Augustiner Chorherrenstift wurde 1499 im Schwabenkrieg zerstört und danach am selben Ort wieder aufgebaut. Zur Zeit der Reformation hielten die Chorherren am alten Glauben fest. Für die Rechte des Klosters setzte sich besonders der damalige Dekan und spätere Abt Georg Tschudi (1545-66) ein. Im Dreissigjährigen Krieg wurde das Stift erneut zerstört und auf Begehren der Stadt Konstanz landeinwärts am heutigen Ort neu erstellt. Abt Jakob Denkinger (1625-60) liess 1650-53 die Kirche nach dem Plan von Michael Beer (erster nachgewiesener sog. Vorarlberger Bau) erbauen, Abt Augustin Gimmi (1660-96) ab 1666 das Kloster und 1672 die Liebfrauenkapelle. 1848 hob der Kanton das Stift auf.

Nach der Zerstörung des Klosters 1499 und dem anschliessenden Wiederaufbau erbat sich der Kreuzlinger Abt Peter von Babenberg an der eidgenössischen Tagsatzung Fensterschenkungen der Orte (Eidgenössische Abschiede, 3,2, S. 434 (1508, r); S. 462 (h, 1509); Erni & Raimann, 2009, S. 73, 183). 1514 kam Bern dieser Bitte nach und schenkte ein Fenster (Trächsel, 1877, S. 197; Erni & Raimann, 2009, S. 183). 1549 bat der damalige Abt Georg von Tschudi erneut an der Tagsatzung um Fensterschenkungen der Stände für sein neu erbautes Abtshaus im Klosterbezirk (Erni & Raimann, 2009, S. 92). 1550 wird festgehalten, dass alle Orte ausser Bern, Freiburg, Solothurn und Appenzell ihm diese Fenstergabe bewilligt hätten (Eidgenössische Abschiede, 4,1, S. 104 (1549); S. 212 (Januar 1550)). Auch Bern stiftete aber 1549 ein Fenster (Berner Ratsmanual 27. 8. 1549; Haller, 1900, S. 140).